L.p. w zał. do Rozporządzenia MRiRW: 57

Tytuł projektu:	Badania nad opracowaniem metod selektywnej izolacji oraz czułej identyfikacji bakterii Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus w trudnych diagnostycznie próbach środowiskowych.
Kierownik projektu:	dr W. Przewodowski
Planowany okres realizacji:	2014-2020

Streszczenie:

Cel główny zostanie osiągnięty poprzez realizację poszczególnych zadań projektu obejmujacych: opracowanie materiałów i procedur do selektywnej izolacji bakterii Cms ze środowiska, opracowanie czułych i specyficznych metod wykrywania bakterii Cms, ocenę przydatności i doskonaleniu procedur pozwalających na izolację i identyfikację Cms w próbach pobranych z naturalnych źródeł występowania tej bakterii. Podjęte zostaną również badania mające na celu określenie zdolności Cms do infekowania roślin utrzymywanych w kulturach in vitro oraz identyfikację źródeł zakażeń mikrobiologicznych w pożywkach hodowlanych i opracowanie sposobu ich eliminacji.
Realizacja zaplanowanych zadań umożliwi opracowanie metod skutecznej izolacji i identyfikacji bakterii z prób środowiskowych sprawiających obecnie kłopoty w diagnostyce. Opracowanie nowych materiałów, znaczników, selektywnych i czułych podłóż do immunokoncentracji umożliwi izolację bakterii Cms z prób o dużych objetościach oraz pozwoli wyeliminować obecność podczas izolacji niekorzystnych substancji, cząsteczek i innych bakterii fałszujących wyniki testów diagnostycznych.
Opracowane materiały i metody wpływając na polepszenie diagnostyki bakterii Cms mogą stać się jednym ze sposobów pozwalających w znaczący sposób zapobiegać rozprzestrzenianiu się sprawcy bakteriozy pierścieniowej ziemniaka w Polsce.

Cel:

Głównym celem badań jest opracowanie materiałów i procedur do selektywnej izolacji i identyfikacji bakterii kwarantannowej bakterii - Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus z różnych prób środowiskowych.

---

2020

• Przewodowski W., Salamońska K., Szarek, Michałowska D., Stochła W., Przewodowska A., Gryń G., Pietraszko M., Franke K. 2019. Badania nad opracowaniem metod selektywnej izolacji oraz czułej identyfikacji bakterii Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus w trudnych diagnostycznie próbach środowiskowych. Biuletyn IHAR (286): 265-269. https://doi.org/10.37317/biul-2019-0060
• Gryń G., Pietraszko M., Przewodowski W., Franke K., Nowakowski M., Nowakowski M. Reaction of the selected potato varieties to Clavibacter sepedonicus infestation under changing weather conditions.  Praca po recenzji, zakwalifikowana do druku w European Journal of Plant Pathology.

2019

• Salamońska K., Przewodowski W., Szarek D., Stochła W., Przewodowska A. 2019. Diagnostyka molekularna bakterii Clavibacter sepedonicus comb. nov. W obecności komponentów tkankowych ziemniaka. (Prezentacja) [W:] Nasiennictwo i Ochrona Ziemniaka, 50 jubileuszowa konferencja naukowo-szkoleniowa, Dźwirzyno, 22-24 maja, Streszczenia: 31.
• Przewodowski W., Przewodowska A., Salamońska K., Szarek D., Stochła-Potentas W. 2019. Opracowanie nowoczesnych materiałów do diagnostyki kwarantannowych bakterii ziemniaka z prób środowiskowych. (Prezentacja) [W:] Nasiennictwo i Ochrona Ziemniaka, 50 jubileuszowa konferencja naukowo-szkoleniowa, Dźwirzyno, 22-24 maja, Streszczenia: 32.

2018

• 
  Salamońska K., Przewodowski W., Szarek D., Stochła W., Przewodowska A. 2018. Ocena obecności śluzów bakteryjnych w diagnostyce molekularnej zróżnicowanych mukoidalnie szczepów bakterii Cms. (Prezentacja) [W:] 51 Konferencja naukowo-szkoleniowa "Nasiennictwo i ochrona ziemniaka", Dźwirzyno, 6-8 czerwca, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 32.
• Stochła W.,Przewodowski W., Salamońska K.,Szarek D.,Przewodowska A. 2018. Oczyszczanie i ocena jakości poliklonalnych przeciwciał króliczych do identyfikacji sprawcy bakteriozy pierścieniowej ziemniaka. (Prezentacja) [W:] 51 Konferencja naukowo-szkoleniowa "Nasiennictwo i ochrona ziemniaka", Dźwirzyno, 6-8 czerwca, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 31.
• Salamońska K., Przewodowski W., Szarek D., Przewodowska A., Stochła W. 2018. Evaluation of DNA isolation to the sensitivity of molecular diagnostics of Cms bacteria. (Poster) [In:] The 43rd FEBS Congress, Prague, Czech Republic, 7-12 July 2018: P.01­080­Tue.(https://2018.febscongress.org/abstract_preview.aspx?idAbstractEnc=4424170094092094093099424170)
• Przewodowski W., Szarek D., Salamońska K., MIchałowska D., Przewodowska A., Stochła W. 2018. Determination of the ability of Clavibacter michiganensis ssp.sepedonicus strains to infect various in vitro cultures of potato. (Poster) [In:] The 43rd FEBS Congress,  Prague, Czech Republic, 7-12 July 2018: P.08¬043¬Mon. (https://2018.febscongress.org/abstract_preview.aspx?idAbstractEnc=4424170094092094092092424170)
• Pietraszko M., Gryń G., Przewodowski W. 2018. An Effect of Weather and Soil Conditions and Their Interaction on Infection of Leaves and Tubers of Potato with Bacteria Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus. Am. J. Potato Res.(2018) 95: 278–285.https://doi.org/10.1007/s12230-017-9629-6.

2017

• Przewodowski W., Przewodowska A. 2017. Opracowanie nowej jakości przeciwciał poliklonalnych wykrywajacych kwarantannowe bakterie Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Prezentacja) [W:] 50 Konferencja naukowo-szkoleniowa "Nasiennictwo i ochrona ziemniaka", Dźwirzyno, 7-9 czerwca, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 37.
• Salamońska K., Przewodowski W. 2017. Wpływ warunków izolacji DNA na czułość testu molekularnego w diagnostyce sprawcy bakteriozy pierścieniowej ziemniaka. (Prezentacja) [W:] 50 Konferencja naukowo-szkoleniowa "Nasiennictwo i ochrona ziemniaka", Dźwirzyno, 7-9 czerwca, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 39.
• Przewodowski W., Przewodowska A., Michałowska D., Salamońska K., Szarek D., Stochła W., Sekrecka D., 2017. Reduction of in vitro plant growth as an effect of pathogenic bacteria interaction. (Poster) [In:] European Biotechnology Congress 2017, EUROBIOTECH, Dubrovnik, Croatia, May 25 – 27. Journal of Biotechnology, Vol 256, Supplement, 2017: 106-107. (doi.org/10.1016/j.jbiotec.2017.06.1165).
• Przewodowski W., Przewodowska A., Michałowska D., Sekrecka D., Salamońska K., Stochła W., Szarek D. 2017. The influence of colloidal metal nanoparticles on in vitro plants of potato. (Short Presentation) [In:] European Biotechnology Congress 2017, EUROBIOTECH, Dubrovnik, Croatia, May 25 – 27. Journal of Biotechnology, Vol 256, Supplement, 2017: 35 (doi.org/10.1016/j.jbiotec.2017.06.667).

2016

• Salamońska K., Przewodowski W., Przewodowska A., Stochła W. 2016. Wpływ enzymów litycznych na izolację DNA oraz czułość testu PCR w diagnostyce kwarantannowych bakterii ziemniaka. Konferencja naukowo – szkoleniowa. Dźwirzyno, 11-13 maja, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 72-73. Poster
• Przewodowski W., Przewodowska A. 2016. The Effect of Colloidal Metals Nanoparticles on Quarantine Bacterium – Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus. 18th International Conference on Biotechnology and Nanotechnology - ICBN 2016, WASET, Wenecja, Włochy 13-14 czerwca 2016r. 18 (6) Part IX: Streszczenia: 1329. Poster
• Gryń G, Pastuszewska T., Przewodowski W. 2016. Ocena patogeniczności wybranych szczepów Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus pochodzących z kolekcji NCPPB w Wielkiej Brytanii. Progress in Plant Protection / Postępy w Ochronie Roślin 56 (1): 73-78. DOI: 10.14199/ppp-2016-013.
• Przewodowski W., Przewodowska A. Sekrecka D., Michałowska D. 2016. The Influence of Colloidal Metal Nanoparticles on Growth and Proliferation of In vitro Cultures of Potato. 18th International Conference on Biotechnology and Nanotechnology - ICBN 2016, WASET, Wenecja, Włochy 13-14 czerwca 2016r. 18 (6) Part IX: Streszczenia: 1330. Poster

2015:

• Pastuszewska T., Gryń G. 2015."Charakterystyka patogeniczności wybranych szczepów Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus z kolekcji zagranicznych." Dźwirzyno, 13-15 maja, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 83-85. Poster
• Pietraszko M., Przewodowski W., Pastuszewska T., Gryń G. 2015. "Podatność wybranych odmian ziemniaka na porażenie bakteriami Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus w zróżnicowanych warunkach glebowych." Dźwirzyno, 13-15 maja, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 85-87. Poster
• Przewodowski W., Stochła W. 2015. "Oczyszczanie przeciwciał króliczych metodą powinowactwa." Dźwirzyno, 13-15 maja, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 87. Poster
• Przewodowska A., Przewodowski W. 2015. "Rapid diagnostic assay for detection of bacteria using colloidal gold nanoparticles." 15 International Conference on Nanotechnology – IEEE NANO 2015, Rzym, Włochy 27 – 30 lipca 2015 r.: 629. Poster
• Pietraszko M., Gryń G., Pastuszewska T., Przewodowski W., Przewodowska A.. 2015. "Podatność wybranych odmian ziemniaka na porażenie bakteriami Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus w zróżnicowanych warunkach glebowych." Biuletyn IHAR-PIB 277: 99 – 108.
• Stochła W., Przewodowska A., Przewodowski W. 2015. "Przydatność przeciwciał króliczych uzyskiwanych dwiema metodami do wykrywania Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus testem DAS-ELISA" Progress in plant protection 55: 352 - 357
• Przewodowski W., Chołuj J., Przewodowska A. 2015. "Wpływ różnych sposobów izolacji kwasów nukleinowych z bakterii na czułość testu PCR" Progress in plant protection 55: 321 - 326

2014:

• Przewodowski W., Przewodowska A. 2014. Interaction between potato proteins and quarantine bacteria Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus. Molecular Plant-Microbe Interactions. International Society of Molecular Plant-Microbe Interactions.6-11.06.2014 Rodos, Grecja: 208. Poster
• Chołuj J., Przewodowski W. 2014. Wpływ sposobu izolacji kwasów nukleinowych bakterii Cms na czułość testu PCR. (poster) (W:) Nasiennictwo i ochrona ziemniaka. Konferencja naukowo-szkoleniowa. Dźwirzyno, 15-16 maja, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia:59. Poster
• Stocha W., Przewodowska A., Przewodowski W. 2014. Wpływ sposobu izolacji przeciwciał króliczych na ich jakość. (poster) (W:) Nasiennictwo i ochrona ziemniaka. Konferencja naukowo-szkoleniowa. Dźwirzyno, 15-16 maja, IHAR-PIB ZNiOZ, Bonin, Streszczenia: 60. Poster
• Chołuj J., Przewodowski W. 2014. Technika PCR i jej modyfikacje w identyfikacji patogenów ziemniaka. Ziemn. Pol. 2: 40-45.
• Stochła W., Przewodowski W., Przewodowska A. 2014. Wybrane metody otrzymywania przeciwciał służących do wykrywania i identyfikacji patogenów ziemniaka. Ziemn. Pol. 3:46-49