Tytuł projektu:	Analiza transkryptomów pszenżyta wykazującego zróżnicowaną odpowiedź na stres glinowy indukowany niskim pH podłoża.
Kierownik projektu:	dr Agnieszka Niedziela
Numer umowy:	UMO-2018/02/X/NZ2/00847 w ramach konkursu „MINIATURA 2”
Termin rozpoczęcia:	2018-10-16
Termin zakończenia:	2019-10-15

Cel badań

Celem badań było poszerzenie wiedzy na temat mechanizmów tolerancyjności na glin u pszenżyta poprzez identyfikację genów ulegających zróżnicowanej ekspresji w wierzchołkach korzeni linii tolerancyjnej (T) i wrażliwej (W). Z korzeni roślin poddanych stresowi glinowemu oraz kontrolnych izolowano RNA, które następnie poddano analizie za pomocą sekwencjonowania następnej generacji (NGS ang. Next Generation Sequencing) na platformie Illuminowej HiSeq4000. Zidentyfikowano ponad 67 tys. genów posiadających minimum trzy zmapowane odczyty dla linii T oraz ponad 80 tys. takich genów dla linii W. Wśród białek o najwyższym stopniu podobieństwa do sekwencji transkryptów genów ulegających podwyższonej ekspresji pod wpływem stresu glinowego w linii T znalazły się białka związane z transportem kationów Al³⁺ oraz związków biorących udział w ich chelatacji, a także białka chroniące rośliny przed stresem oksydacyjnym. U linii W były to między innymi geny kodujące białka zaangażowane w syntezę składników ścian komórkowych, śluzów oraz metabolitów wtórnych. Otrzymane wyniki wskazują na działanie odrębnych mechanizmów ochrony pszenżyta przed działaniem toksycznych jonów Al³⁺ w zależności od genotypu, o czym świadczy zróżnicowanie w obrębie genów ulegających zmianom ekspresji pod wpływem stresu u roślin tolerancyjnych (T) i wrażliwych (W).