Tytuł projektu: [start]Badanie genomu rzepaku ozimego przy wykorzystaniu markerów molekularnych. [koniec]
Kierownik projektu: prof. dr hab. I. Bartkowiak-Broda
Planowany okres realizacji: 2014-2020

Streszczenie:

Projekt dotyczy analizy molekularnej i fenotypowej różnych genotypów rzepaku ozimego. Materiałem do badań będą ważne gospodarczo odmiany hodowlane, linie podwojonych haploidów (DH), komponenty rodzicielskie mieszańców F1 w systemie CMS ogura, formy o zmienionym składzie kwasów tłuszczowych, o obniżonej zawartości włókna paszowego (żółtonasienne), jak również wartościowe formy B. napus otrzymane w wyniku resyntezy. Proponowane w ramach zadania tematy badawcze obejmują analizę genotypów badanych roślin z zastosowaniem różnego rodzaju markerów genetycznych oraz ocenę fenologiczną i fenotypową badanej kolekcji w doświadczeniach polowych. Do analiz zostaną zastosowane markery genetyczne typu AFLP, mikrosatelitarne, typu SCAR w systemie wielokrotnym (multipleks PCR), SNP oraz CAPS. Planowane jest przeprowadzenie doświadczeń polowych, po uprzednim namnożeniu materiału siewnego, w dwóch środowiskach, w trzech powtórzeniach. Obliczenia i analizy statystyczne zostaną przeprowadzone z wykorzystaniem pakietu statystycznego GenStat. Planowany projekt włącza się w rozwijający się intensywnie nurt badań nad rzepakiem w świecie, dotyczący identyfikowania markerów genetycznych oraz opracowywania metod efektywnej selekcji określonych genotypów w programach hodowli (ang. MAB, marker-assisted breeding). Otrzymane wyniki umożliwią molekularną charakterystykę badanych genotypów oraz identyfikację markerów genetycznych zasocjowanych z ważnymi cechami badanych linii i odmian rzepaku. Ponadto, przy wysokim nasyceniu markerami, możliwe będzie badanie rearanżacji genomów w wyniku krzyżowania różnych genotypów. 

Cel:

Celem zadania jest: (1) identyfikacja markerów genetycznych charakterystycznych dla badanych odmian i linii hodowlanych rzepaku ozimego (finger-printing), (2) określenie stopnia zróżnicowania genetycznego pomiędzy liniami rodzicielskimi mieszańców F1 w systemie CMS ogura,
(3) charakterystyka fenotypowa badanej kolekcji oraz (4) przeprowadzenie analiz asocjacyjnych. Uzyskane wyniki będą stanowiły podstawę do analiz strukturalnych i funkcjonalnych badanych genomów służąc skutecznej selekcji w hodowli twórczej.


Pliki do pobrania:

2018

  •  Liersch, Mikołajczyk K., Bocianowski J., Popławska W., Nowakowska J., Matuszczak M., Michalski K., Krotka K., Bartkowiak-Broda I. 2018. Association of microsatellite and AFLP markers with yield and seed quality in winter oilseed rape (Brassica napus L.). 21th Crucifer Genetics Conference Brassica 2018, 1-4 July 2018, Saint-Malo, Fracne.
  • Liersch A., Mikołajczyk K., Bocianowski J., Popławska W., Nowakowska J., Matuszczak M., Bartkowiak-Broda I., Micha;slo K., Krótka K., 2018. Analizy asocjacyjne markerów mikrosatelitarnych i AFLP z plonem oraz cechami jakościowymi nasion rzepaku ozimego (Brassica napus L.) Rośliny Oleiste - postępy w genetyce, hodowli, technologii i analityce lipidów

2016

  • Mikołajczyk K., Dabert M., Karłowski W.M., Bocianowski J., Nowakowska J., Spasibionek S., Popławska W., Liersch A., Cegielska-Taras T., Bartkowiak-Broda I., 2016. "Analizy molekularne w programach hodowli rzepaku ozimego w IHAR-PIB Oddział Poznań", XXXIII Konferencja Naukowa, Rosliny Oleiste - postępy w genetyce, hodowli, technologii i analityce lipidów.
  • Mikołajczyk K., Nowakowska J., Bocianowski J., Liersch A., Popławska W., Spasibionek S., Cegielska-Taras T., Bartkowiak-Broda I., 2016. "Assessment of genetic diversity among ailseed rape (Brassica napus L.) cultivars using single locus microsatellite markers". 20th EUCARPIA General Congress.
  • Liersch A., Mikołajczyk K., Popławska W., Spasibionek S., Cegielska-Taras T., Bocianowski J., Nowakowska J., Bartkowiak-Broda I., 2016. "AFLP and STR markers - a valuable tool for genetic diversity analysis of winter rapeseed (B. napus L.)". Polski Kongres Genetyki, 19-22 września 2016

2015

  • Liersh A., Bocianowski J., Popławska W., Spasibionek S., Piętka T., Cegielska-Taras T., Bartkowiak-Broda  I., Mikołajczyk K. "Molecular characteristics of oilseed rape genetic resources collection" from the IHAR-NRI, Research Division in Poznań, 


Załączniki:

Wyniki i publikacje za rok 2018
Wyniki za rok 2017
Wyniki i publikacje za rok 2016
Wyniki i publikacje za rok 2015
Wyniki za rok 2014