Streszczenie:

Zjawisko cytoplazmatycznej męskiej sterylności u roślin jest warunkowane interakcją genomu mitochondrialnego oraz jądrowego. Oddziaływania pomiędzy tymi genomami mają charakter dwukierunkowy a jego natura jest wciąż nie do końca poznana. Nawet wydawałoby się najprostsza część tego zjawiska jaką są geny jądrowe przywracanie płodności pyłku oraz interakcje między nimi u roślin zbożowych nie są do końca poznane. Szeroko zakrojone prace realizowane w Niemczech umożliwiły identyfikację markerów tych genów w przypadku cms typu pampa. Markery te nie są dostępne publicznie. Analogiczne prace prowadzone w Polsce umożliwiły wytypowanie puli markerów DNA sprzężonych z większością genów przywracania płodności u żyta z cms pampa. Jednak w wielu przypadkach markery te nie są dostatecznie silnie sprzężone z tymi genami lub nie otaczają gen z dwóch jego stron. Utrudnia to kontrolę wyprowadzenia linii o określonym składzie genów i badanie relacji pomiędzy tymi genami. Opracowanie dostatecznie silnie sprzężonych/asocjowanych z tymi genami markerów molekularnych otwiera perspektywę sekwencjonowania obszarów genomu odpowiedzialnych za ekspresję cechy i poznanie ich funkcji, stwarza perspektywę poznania podstaw genetycznych zjawiska, otwiera perspektywę badania interakcji pomiędzy genomem jądrowym i mitochondrialnym u roślin.

Cel:

Celem projektu jest identyfikacja markerów molekularnych DNA (markery DArTseq czy GBS) silnie sprzężonych/asocjowanych z jądrowymi genami przywracania płodności pyłku u żyta z cms pampa, które mogłyby być wykorzystane na szerszej puli genetycznej w oparciu o liczne populacje linii rekombinacyjnych (RIL). Wykorzystanie RIL pozwala na bardziej precyzyjne niż to ma miejsce w przypadku populacji F2 lokalizowania markerów cech. W połączeniu z technologią sekwencjonowania nowej generacji doprowadzi do opracowania nowych markerów DNA użytecznych w badaniu interakcji genów odpowiedzialnych za ekspresję cechy.

2017

• Poster - A. Grzesik,M. Szeląg, W. Brukwiński, B. Kozber, M. Zając, P.T Bednarek. A high-density genetic map of winter rye (Secale cereale L.) based on DArTseq and silico DArT markers. 4th International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources, 03.09.2017-07.09.2017, Giessen, Niemcy
• Poster - A. Grzesik,M. Szeląg, W. Brukwiński, B. Kozber, M. Zając, P.T. Bednarek. The identification of DNA markers tightly linked to pollen-fertility restoration genes in rye (Secale cereale L.) with CMS Pampa using RIL mapping population. 4th International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources, 03.09.2017-07.09.2017, Giessen, Niemcy

2016

• Koc K., Niedziela A., Kozber B., Brukwiński W., Zając M., Bednarek P.T., Identyfication of pollen fertility restoration markers in rye with CMS Pampa

2015

• Koc K., Niedziela A., Kozber B., Brukwiński W., Materka M., Bednarek P.T. - "Identification of pollen fertility restoration markers in rye with cms pampa", 
• Koc K., Kozber B., Brukwiński W., Materka M., Bednarek P.T. - "DNA markers in selection of restorer forms with CMS Pampa in rye", 
• Koc K., Kozber B., Brukwiński W., Materka M., Bednarek P.T. - "Markery DNA w selekcji form restorerowych z CMS Pampa u żyta", 

Załączniki: