L.p. w zał. do Rozporządzenia MRiRW: 21
| Tytuł projektu: | Poszukiwanie markerów molekularnych genów przywracania płodności pyłku u żyta (Secale cereale L.) z CMS-Pampa. |
| Kierownik projektu: | dr hab. P. Bednarek prof. IHAR-PIB |
| Planowany okres realizacji: | 2014-2020 |
Streszczenie:
Zjawisko cytoplazmatycznej męskiej sterylności u roślin jest warunkowane interakcją genomu mitochondrialnego oraz jądrowego. Oddziaływania pomiędzy tymi genomami mają charakter dwukierunkowy a jego natura jest wciąż nie do końca poznana. Nawet wydawałoby się najprostsza część tego zjawiska jaką są geny jądrowe przywracanie płodności pyłku oraz interakcje między nimi u roślin zbożowych nie są do końca poznane. Szeroko zakrojone prace realizowane w Niemczech umożliwiły identyfikację markerów tych genów w przypadku cms typu pampa. Markery te nie są dostępne publicznie. Analogiczne prace prowadzone w Polsce umożliwiły wytypowanie puli markerów DNA sprzężonych z większością genów przywracania płodności u żyta z cms pampa. Jednak w wielu przypadkach markery te nie są dostatecznie silnie sprzężone z tymi genami lub nie otaczają gen z dwóch jego stron. Utrudnia to kontrolę wyprowadzenia linii o określonym składzie genów i badanie relacji pomiędzy tymi genami. Opracowanie dostatecznie silnie sprzężonych/asocjowanych z tymi genami markerów molekularnych otwiera perspektywę sekwencjonowania obszarów genomu odpowiedzialnych za ekspresję cechy i poznanie ich funkcji, stwarza perspektywę poznania podstaw genetycznych zjawiska, otwiera perspektywę badania interakcji pomiędzy genomem jądrowym i mitochondrialnym u roślin.
Cel:
Celem projektu jest identyfikacja markerów molekularnych DNA (markery DArTseq czy GBS) silnie sprzężonych/asocjowanych z jądrowymi genami przywracania płodności pyłku u żyta z cms pampa, które mogłyby być wykorzystane na szerszej puli genetycznej w oparciu o liczne populacje linii rekombinacyjnych (RIL). Wykorzystanie RIL pozwala na bardziej precyzyjne niż to ma miejsce w przypadku populacji F2 lokalizowania markerów cech. W połączeniu z technologią sekwencjonowania nowej generacji doprowadzi do opracowania nowych markerów DNA użytecznych w badaniu interakcji genów odpowiedzialnych za ekspresję cechy.
2020
- Wasiak M., Brukwiński W., Bednarek P.T., 2020. Genetic mapping of pollen fertility restoration QTLs in rye (Secale cereale L.) with CMS Pampa. https://doi.org/10.1007/s13353-020-00599-9, Journal of Applied Genetics.
2019
- Niedziela A., Wasiak M., Kozber B., Brukwiński W., Bednarek P.T. 2019. Genetic map for identification of molecular markers associated with pollen fertility restoration genes in winter rye with CMS PAMPA. Global Conference on Plant Science and Microbial Ecology 17-19 czerwca 2019 Walencja Hiszpania
2017
- Poster - A. Grzesik,M. Szeląg, W. Brukwiński, B. Kozber, M. Zając, P.T Bednarek. A high-density genetic map of winter rye (Secale cereale L.) based on DArTseq and silico DArT markers. 4th International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources, 03.09.2017-07.09.2017, Giessen, Niemcy
- Poster - A. Grzesik,M. Szeląg, W. Brukwiński, B. Kozber, M. Zając, P.T. Bednarek. The identification of DNA markers tightly linked to pollen-fertility restoration genes in rye (Secale cereale L.) with CMS Pampa using RIL mapping population. 4th International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources, 03.09.2017-07.09.2017, Giessen, Niemcy
2016
- Koc K., Niedziela A., Kozber B., Brukwiński W., Zając M., Bednarek P.T., Identyfication of pollen fertility restoration markers in rye with CMS Pampa
2015
- Koc K., Niedziela A., Kozber B., Brukwiński W., Materka M., Bednarek P.T. - "Identification of pollen fertility restoration markers in rye with cms pampa",
- Koc K., Kozber B., Brukwiński W., Materka M., Bednarek P.T. - "DNA markers in selection of restorer forms with CMS Pampa in rye",
- Koc K., Kozber B., Brukwiński W., Materka M., Bednarek P.T. - "Markery DNA w selekcji form restorerowych z CMS Pampa u żyta",